Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCLP18206 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCLP18206 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCLP18206 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCLP18206 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCLP18206 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCLP18206 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCLP18206 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCLP18206 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCLP18206 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms