Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCP1P17987 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCP1P17987 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCP1P17987 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCP1P17987 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCP1P17987 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCP1P17987 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCP1P17987 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCP1P17987 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCP1P17987 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms