Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFXP16104 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms