Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB2P14652 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB2P14652 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms