Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM27P14373 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms