Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCP1P13796 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCP1P13796 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCP1P13796 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCP1P13796 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCP1P13796 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCP1P13796 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms