Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALM1P0DP23 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM1P0DP23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms