Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBSLP0DN79 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBSLP0DN79 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms