Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM49CP0CI26 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms