Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT7P08729 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT7P08729 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT7P08729 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT7P08729 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms