Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms