Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGAP02671 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGAP02671 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGAP02671 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGAP02671 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGAP02671 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGAP02671 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FGAP02671 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGAP02671 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms