Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA2P02652 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA2P02652 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA2P02652 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA2P02652 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA2P02652 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA2P02652 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA2P02652 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA2P02652 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA2P02652 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA2P02652 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA2P02652 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA2P02652 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms