Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINA1P01009 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms