Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINC1P01008 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINC1P01008 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINC1P01008 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINC1P01008 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINC1P01008 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms