Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNTO95613 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNTO95613 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNTO95613 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNTO95613 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNTO95613 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCNTO95613 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNTO95613 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNTO95613 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNTO95613 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNTO95613 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNTO95613 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNTO95613 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNTO95613 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNTO95613 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms