Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDKL5O76039 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms