Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CILPO75339 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CILPO75339 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CILPO75339 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CILPO75339 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CILPO75339 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CILPO75339 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms