Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NIPSNAP2O75323 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms