Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms