Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP2AO43633 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms