Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCXO43602 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCXO43602 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCXO43602 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCXO43602 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCXO43602 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCXO43602 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCXO43602 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCXO43602 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCXO43602 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCXO43602 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCXO43602 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCXO43602 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCXO43602 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCXO43602 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCXO43602 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCXO43602 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms