Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERI3O43414 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERI3O43414 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERI3O43414 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERI3O43414 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms