Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTSS1O43312 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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