Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.092e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 36.08□□□□□ -1.442e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.357e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)22.81■■□□□ 1.249e-8■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.939e-8■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 219.87■□□□□ 0.779e-8■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.759e-8■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 219.25■□□□□ 0.679e-8■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.579e-8■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 04e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BTBD10-202ENST00000525108 1139 ntTSL 514.9□□□□□ -0.024e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BTBD10-209ENST00000529708 616 ntTSL 514.71□□□□□ -0.054e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BTBD10-201ENST00000278174 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BTBD10-205ENST00000526841 508 ntTSL 411.49□□□□□ -0.574e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BTBD10-206ENST00000527102 2338 ntTSL 211.26□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BTBD10-204ENST00000525864 1325 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BTBD10-207ENST00000527858 249 ntTSL 57.89□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 517.06■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 GOLGA2-209ENST00000490257 1964 ntTSL 218.83■□□□□ 0.613e-13■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 GOLGA2-202ENST00000450617 1439 ntTSL 513.81□□□□□ -0.23e-13■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 GOLGA2-206ENST00000468488 531 ntTSL 311.84□□□□□ -0.513e-13■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 517.04■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 FAM160A1-204ENST00000508198 604 ntTSL 416.16■□□□□ 0.184e-14■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 FAM160A1-202ENST00000503146 570 ntTSL 515.69■□□□□ 0.14e-14■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.344e-14■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 FAM160A1-205ENST00000511501 304 ntTSL 311.01□□□□□ -0.654e-14■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 FAM160A1-207ENST00000513086 401 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-14■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.278e-8■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.238e-8■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.858e-8■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 518.59■□□□□ 0.578e-8■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 TMEM259-211ENST00000593068 1965 ntTSL 518.53■□□□□ 0.568e-8■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 CLTC-213ENST00000584313 715 ntTSL 313.66□□□□□ -0.226e-11■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.336e-11■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.466e-11■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 CLTC-212ENST00000580081 575 ntTSL 48.73□□□□□ -1.016e-11■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.076e-11■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.216e-11■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.422e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.392e-7■■■■□ 23.4
PRPF4O43172 GPS1-223ENST00000584229 535 ntTSL 323.7■■□□□ 1.384e-7■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 GPS1-209ENST00000578642 579 ntTSL 417.52■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 FUBP3-203ENST00000467100 2228 ntTSL 224.34■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.982e-7■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 TAOK3-216ENST00000542532 641 ntTSL 225.06■■□□□ 1.62e-6■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 TAOK3-217ENST00000542692 588 ntTSL 322.9■■□□□ 1.262e-6■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 PLCXD1-208ENST00000445062 555 ntTSL 420.53■□□□□ 0.882e-10■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.784e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.094e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.134e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-218ENST00000600510 1085 ntTSL 213.46□□□□□ -0.254e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-214ENST00000598246 553 ntTSL 312.16□□□□□ -0.464e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-202ENST00000351660 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-221ENST00000601537 1176 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.734e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-220ENST00000600864 464 ntTSL 59.8□□□□□ -0.844e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 DHPS-222ENST00000601639 1133 ntTSL 59.46□□□□□ -0.94e-9■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.665e-8■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.45e-8■■■■□ 23.3
PRPF4O43172 PNCK-216ENST00000458354 498 ntTSL 327.54■■■□□ 22e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNCK-209ENST00000423545 448 ntTSL 417.69■□□□□ 0.422e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNCK-207ENST00000419804 561 ntTSL 417.11■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNCK-210ENST00000425526 725 ntTSL 515.24■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 519.34■□□□□ 0.695e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EME2-206ENST00000570069 5613 ntTSL 218.12■□□□□ 0.497e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EXOC5-206ENST00000555148 2349 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EXOC5-204ENST00000554598 772 ntTSL 216.96■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CCNI-205ENST00000507788 595 ntTSL 415.87■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EXOC5-208ENST00000556318 518 ntTSL 415.42■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EXOC5-207ENST00000555749 594 ntTSL 211.25□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CCNI-209ENST00000515790 390 ntTSL 210.52□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CCNI-207ENST00000513774 517 ntTSL 47.59□□□□□ -1.193e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CCNI-203ENST00000505609 541 ntTSL 46.37□□□□□ -1.393e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 23.2
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