Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX7O00628 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX7O00628 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX7O00628 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX7O00628 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX7O00628 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX7O00628 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PEX7O00628 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX7O00628 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PEX7O00628 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX7O00628 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX7O00628 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX7O00628 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms