Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN34H7C241 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN34H7C241 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms