Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3BRM9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3BRM9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3BRM9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3BRM9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3BRM9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms