Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BQV1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQV1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQV1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQV1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQV1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQV1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQV1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQV1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQV1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQV1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQV1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQV1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms