Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LMO7DNF2Z398 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms