Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
E9PCH4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
E9PCH4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
E9PCH4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
E9PCH4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
E9PCH4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
E9PCH4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
E9PCH4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
E9PCH4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
E9PCH4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
E9PCH4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
E9PCH4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
E9PCH4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
E9PCH4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
E9PCH4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
E9PCH4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
E9PCH4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
E9PCH4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
E9PCH4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
E9PCH4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
E9PCH4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
E9PCH4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
E9PCH4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
E9PCH4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
E9PCH4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
E9PCH4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
E9PCH4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
E9PCH4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
E9PCH4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E9PCH4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms