Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCRIP1C9JLW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms