Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF487B1APH4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF487B1APH4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms