Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms