Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRIQ3A6PVS8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms