Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM187AA6NFU0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms