Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF2A6NFQ2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms