Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEFA5A3E0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms