Protein–RNA interactions for Protein: A0AV96

RBM47, RNA-binding protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM47A0AV96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM47A0AV96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM47A0AV96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms