Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPRJQ12913 TACC2-201ENST00000260733 3644 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CDK13-206ENST00000611390 2222 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 DESI1-201ENST00000263256 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPRJQ12913 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPRJQ12913 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPRJQ12913 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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PTPRJQ12913 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 ADH7-204ENST00000476959 1325 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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