Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPRBQ9Y5M8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPRBQ9Y5M8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms