Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB2Q9Y5E7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms