Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF330Q9Y3S2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms