Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1Q9Y3L3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms