Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIKFYVEQ9Y2I7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.3 ms