Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms