Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC3Q9UQE7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms