Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP164Q9UPV0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP164Q9UPV0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP164Q9UPV0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms