Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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