Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC7AQ9ULT0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms